NeuroAnalyzer tutorials: MEG
Initialize NeuroAnalyzer
using NeuroAnalyzer;Currently, MEG functionality is very limited.
Load MEG data:
meg = import_fiff("files/meg.fif");Show signal details:
info(meg) Data type: MEG
File format: FIFF
Source file: files/meg.fif
File size [MB]: 40.0
Memory size [MB]: 80.38
Subject: 2: Subject Subject
Recording: TRIUX system
Recording notes:
Recording date:
Recording time:
Sampling rate (Hz): 1000
Signal length [samples]: 32000
Signal length [seconds]: 32.0
Number of channels: 327
Epochs ID:
Number of epochs: 1
Epoch length [samples]: 32000
Epoch length [seconds]: 32.0
Line frequency: 50.0 Hz
Markers: no
Channel locations: yes
Components: no
Number of MAG channels: 102
Number of GRAD channels: 204
Number of EEG channels: 0
Channels:
ch label type unit bad
------ --------------- ----------- ------- -------
1 IAS 307 OTHER V false
2 IAS 306 OTHER V false
3 IAS 309 OTHER V false
4 IAS 308 OTHER V false
5 IAS 311 OTHER V false
6 IAS 310 OTHER V false
7 IAS 302 OTHER V false
8 IAS 304 OTHER V false
9 IAS 301 OTHER V false
10 IAS 303 OTHER V false
11 IAS 305 OTHER V false
12 MEG 111 MAG fT false
13 MEG 112 GRAD fT/cm false
14 MEG 113 GRAD fT/cm false
15 MEG 121 MAG fT false
16 MEG 122 GRAD fT/cm false
17 MEG 123 GRAD fT/cm false
18 MEG 131 MAG fT false
19 MEG 132 GRAD fT/cm false
20 MEG 133 GRAD fT/cm false
21 MEG 141 MAG fT false
22 MEG 142 GRAD fT/cm false
23 MEG 143 GRAD fT/cm false
24 MEG 211 MAG fT false
25 MEG 212 GRAD fT/cm false
26 MEG 213 GRAD fT/cm false
27 MEG 221 MAG fT false
28 MEG 222 GRAD fT/cm false
29 MEG 223 GRAD fT/cm false
30 MEG 231 MAG fT false
31 MEG 232 GRAD fT/cm false
32 MEG 233 GRAD fT/cm false
33 MEG 241 MAG fT false
34 MEG 242 GRAD fT/cm false
35 MEG 243 GRAD fT/cm false
36 MEG 311 MAG fT false
37 MEG 312 GRAD fT/cm false
38 MEG 313 GRAD fT/cm false
39 MEG 321 MAG fT false
40 MEG 322 GRAD fT/cm false
41 MEG 323 GRAD fT/cm false
42 MEG 331 MAG fT false
43 MEG 332 GRAD fT/cm false
44 MEG 333 GRAD fT/cm false
45 MEG 341 MAG fT false
46 MEG 342 GRAD fT/cm false
47 MEG 343 GRAD fT/cm false
48 MEG 411 MAG fT false
49 MEG 412 GRAD fT/cm false
50 MEG 413 GRAD fT/cm false
51 MEG 421 MAG fT false
52 MEG 422 GRAD fT/cm false
53 MEG 423 GRAD fT/cm false
54 MEG 431 MAG fT false
55 MEG 432 GRAD fT/cm false
56 MEG 433 GRAD fT/cm false
57 MEG 441 MAG fT false
58 MEG 442 GRAD fT/cm false
59 MEG 443 GRAD fT/cm false
60 MEG 511 MAG fT false
61 MEG 512 GRAD fT/cm false
62 MEG 513 GRAD fT/cm false
63 MEG 521 MAG fT false
64 MEG 522 GRAD fT/cm false
65 MEG 523 GRAD fT/cm false
66 MEG 531 MAG fT false
67 MEG 532 GRAD fT/cm false
68 MEG 533 GRAD fT/cm false
69 MEG 541 MAG fT false
70 MEG 542 GRAD fT/cm false
71 MEG 543 GRAD fT/cm false
72 MEG 611 MAG fT false
73 MEG 612 GRAD fT/cm false
74 MEG 613 GRAD fT/cm false
75 MEG 621 MAG fT false
76 MEG 622 GRAD fT/cm false
77 MEG 623 GRAD fT/cm false
78 MEG 631 MAG fT false
79 MEG 632 GRAD fT/cm false
80 MEG 633 GRAD fT/cm false
81 MEG 641 MAG fT false
82 MEG 642 GRAD fT/cm false
83 MEG 643 GRAD fT/cm false
84 MEG 711 MAG fT false
85 MEG 712 GRAD fT/cm false
86 MEG 713 GRAD fT/cm false
87 MEG 721 MAG fT false
88 MEG 722 GRAD fT/cm false
89 MEG 723 GRAD fT/cm false
90 MEG 731 MAG fT false
91 MEG 732 GRAD fT/cm false
92 MEG 733 GRAD fT/cm false
93 MEG 741 MAG fT false
94 MEG 742 GRAD fT/cm false
95 MEG 743 GRAD fT/cm false
96 MEG 811 MAG fT false
97 MEG 812 GRAD fT/cm false
98 MEG 813 GRAD fT/cm false
99 MEG 821 MAG fT false
100 MEG 822 GRAD fT/cm false
101 MEG 823 GRAD fT/cm false
102 MEG 911 MAG fT false
103 MEG 912 GRAD fT/cm false
104 MEG 913 GRAD fT/cm false
105 MEG 921 MAG fT false
106 MEG 922 GRAD fT/cm false
107 MEG 923 GRAD fT/cm false
108 MEG 931 MAG fT false
109 MEG 932 GRAD fT/cm false
110 MEG 933 GRAD fT/cm false
111 MEG 941 MAG fT false
112 MEG 942 GRAD fT/cm false
113 MEG 943 GRAD fT/cm false
114 MEG 1011 MAG fT false
115 MEG 1012 GRAD fT/cm false
116 MEG 1013 GRAD fT/cm false
117 MEG 1021 MAG fT false
118 MEG 1022 GRAD fT/cm false
119 MEG 1023 GRAD fT/cm false
120 MEG 1031 MAG fT false
121 MEG 1032 GRAD fT/cm false
122 MEG 1033 GRAD fT/cm false
123 MEG 1041 MAG fT false
124 MEG 1042 GRAD fT/cm false
125 MEG 1043 GRAD fT/cm false
126 MEG 1111 MAG fT false
127 MEG 1112 GRAD fT/cm false
128 MEG 1113 GRAD fT/cm false
129 MEG 1121 MAG fT false
130 MEG 1122 GRAD fT/cm false
131 MEG 1123 GRAD fT/cm false
132 MEG 1131 MAG fT false
133 MEG 1132 GRAD fT/cm false
134 MEG 1133 GRAD fT/cm false
135 MEG 1141 MAG fT false
136 MEG 1142 GRAD fT/cm false
137 MEG 1143 GRAD fT/cm false
138 MEG 1211 MAG fT false
139 MEG 1212 GRAD fT/cm false
140 MEG 1213 GRAD fT/cm false
141 MEG 1221 MAG fT false
142 MEG 1222 GRAD fT/cm false
143 MEG 1223 GRAD fT/cm false
144 MEG 1231 MAG fT false
145 MEG 1232 GRAD fT/cm false
146 MEG 1233 GRAD fT/cm false
147 MEG 1241 MAG fT false
148 MEG 1242 GRAD fT/cm false
149 MEG 1243 GRAD fT/cm false
150 MEG 1311 MAG fT false
151 MEG 1312 GRAD fT/cm false
152 MEG 1313 GRAD fT/cm false
153 MEG 1321 MAG fT false
154 MEG 1322 GRAD fT/cm false
155 MEG 1323 GRAD fT/cm false
156 MEG 1331 MAG fT false
157 MEG 1332 GRAD fT/cm false
158 MEG 1333 GRAD fT/cm false
159 MEG 1341 MAG fT false
160 MEG 1342 GRAD fT/cm false
161 MEG 1343 GRAD fT/cm false
162 MEG 1411 MAG fT false
163 MEG 1412 GRAD fT/cm false
164 MEG 1413 GRAD fT/cm false
165 MEG 1421 MAG fT false
166 MEG 1422 GRAD fT/cm false
167 MEG 1423 GRAD fT/cm false
168 MEG 1431 MAG fT false
169 MEG 1432 GRAD fT/cm false
170 MEG 1433 GRAD fT/cm false
171 MEG 1441 MAG fT false
172 MEG 1442 GRAD fT/cm false
173 MEG 1443 GRAD fT/cm false
174 MEG 1511 MAG fT false
175 MEG 1512 GRAD fT/cm false
176 MEG 1513 GRAD fT/cm false
177 MEG 1521 MAG fT false
178 MEG 1522 GRAD fT/cm false
179 MEG 1523 GRAD fT/cm false
180 MEG 1531 MAG fT false
181 MEG 1532 GRAD fT/cm false
182 MEG 1533 GRAD fT/cm false
183 MEG 1541 MAG fT false
184 MEG 1542 GRAD fT/cm false
185 MEG 1543 GRAD fT/cm false
186 MEG 1611 MAG fT false
187 MEG 1612 GRAD fT/cm false
188 MEG 1613 GRAD fT/cm false
189 MEG 1621 MAG fT false
190 MEG 1622 GRAD fT/cm false
191 MEG 1623 GRAD fT/cm false
192 MEG 1631 MAG fT false
193 MEG 1632 GRAD fT/cm false
194 MEG 1633 GRAD fT/cm false
195 MEG 1641 MAG fT false
196 MEG 1642 GRAD fT/cm false
197 MEG 1643 GRAD fT/cm false
198 MEG 1711 MAG fT false
199 MEG 1712 GRAD fT/cm false
200 MEG 1713 GRAD fT/cm false
201 MEG 1721 MAG fT false
202 MEG 1722 GRAD fT/cm false
203 MEG 1723 GRAD fT/cm false
204 MEG 1731 MAG fT false
205 MEG 1732 GRAD fT/cm false
206 MEG 1733 GRAD fT/cm false
207 MEG 1741 MAG fT false
208 MEG 1742 GRAD fT/cm false
209 MEG 1743 GRAD fT/cm false
210 MEG 1811 MAG fT false
211 MEG 1812 GRAD fT/cm false
212 MEG 1813 GRAD fT/cm false
213 MEG 1821 MAG fT false
214 MEG 1822 GRAD fT/cm false
215 MEG 1823 GRAD fT/cm false
216 MEG 1831 MAG fT false
217 MEG 1832 GRAD fT/cm false
218 MEG 1833 GRAD fT/cm false
219 MEG 1841 MAG fT false
220 MEG 1842 GRAD fT/cm false
221 MEG 1843 GRAD fT/cm false
222 MEG 1911 MAG fT false
223 MEG 1912 GRAD fT/cm false
224 MEG 1913 GRAD fT/cm false
225 MEG 1921 MAG fT false
226 MEG 1922 GRAD fT/cm false
227 MEG 1923 GRAD fT/cm false
228 MEG 1931 MAG fT false
229 MEG 1932 GRAD fT/cm false
230 MEG 1933 GRAD fT/cm false
231 MEG 1941 MAG fT false
232 MEG 1942 GRAD fT/cm false
233 MEG 1943 GRAD fT/cm false
234 MEG 2011 MAG fT false
235 MEG 2012 GRAD fT/cm false
236 MEG 2013 GRAD fT/cm false
237 MEG 2021 MAG fT false
238 MEG 2022 GRAD fT/cm false
239 MEG 2023 GRAD fT/cm false
240 MEG 2031 MAG fT false
241 MEG 2032 GRAD fT/cm false
242 MEG 2033 GRAD fT/cm false
243 MEG 2041 MAG fT false
244 MEG 2042 GRAD fT/cm false
245 MEG 2043 GRAD fT/cm false
246 MEG 2111 MAG fT false
247 MEG 2112 GRAD fT/cm false
248 MEG 2113 GRAD fT/cm false
249 MEG 2121 MAG fT false
250 MEG 2122 GRAD fT/cm false
251 MEG 2123 GRAD fT/cm false
252 MEG 2131 MAG fT false
253 MEG 2132 GRAD fT/cm false
254 MEG 2133 GRAD fT/cm false
255 MEG 2141 MAG fT false
256 MEG 2142 GRAD fT/cm false
257 MEG 2143 GRAD fT/cm false
258 MEG 2211 MAG fT false
259 MEG 2212 GRAD fT/cm false
260 MEG 2213 GRAD fT/cm false
261 MEG 2221 MAG fT false
262 MEG 2222 GRAD fT/cm false
263 MEG 2223 GRAD fT/cm false
264 MEG 2231 MAG fT false
265 MEG 2232 GRAD fT/cm false
266 MEG 2233 GRAD fT/cm false
267 MEG 2241 MAG fT false
268 MEG 2242 GRAD fT/cm false
269 MEG 2243 GRAD fT/cm false
270 MEG 2311 MAG fT false
271 MEG 2312 GRAD fT/cm false
272 MEG 2313 GRAD fT/cm false
273 MEG 2321 MAG fT false
274 MEG 2322 GRAD fT/cm false
275 MEG 2323 GRAD fT/cm false
276 MEG 2331 MAG fT false
277 MEG 2332 GRAD fT/cm false
278 MEG 2333 GRAD fT/cm false
279 MEG 2341 MAG fT false
280 MEG 2342 GRAD fT/cm false
281 MEG 2343 GRAD fT/cm false
282 MEG 2411 MAG fT false
283 MEG 2412 GRAD fT/cm false
284 MEG 2413 GRAD fT/cm false
285 MEG 2421 MAG fT false
286 MEG 2422 GRAD fT/cm false
287 MEG 2423 GRAD fT/cm false
288 MEG 2431 MAG fT false
289 MEG 2432 GRAD fT/cm false
290 MEG 2433 GRAD fT/cm false
291 MEG 2441 MAG fT false
292 MEG 2442 GRAD fT/cm false
293 MEG 2443 GRAD fT/cm false
294 MEG 2511 MAG fT false
295 MEG 2512 GRAD fT/cm false
296 MEG 2513 GRAD fT/cm false
297 MEG 2521 MAG fT false
298 MEG 2522 GRAD fT/cm false
299 MEG 2523 GRAD fT/cm false
300 MEG 2531 MAG fT false
301 MEG 2532 GRAD fT/cm false
302 MEG 2533 GRAD fT/cm false
303 MEG 2541 MAG fT false
304 MEG 2542 GRAD fT/cm false
305 MEG 2543 GRAD fT/cm false
306 MEG 2611 MAG fT false
307 MEG 2612 GRAD fT/cm false
308 MEG 2613 GRAD fT/cm false
309 MEG 2621 MAG fT false
310 MEG 2622 GRAD fT/cm false
311 MEG 2623 GRAD fT/cm false
312 MEG 2631 MAG fT false
313 MEG 2632 GRAD fT/cm false
314 MEG 2633 GRAD fT/cm false
315 MEG 2641 MAG fT false
316 MEG 2642 GRAD fT/cm false
317 MEG 2643 GRAD fT/cm false
318 STIM 1 MRK V false
319 STIM 2 MRK V false
320 STIM 3 MRK V false
321 STIM 4 MRK V false
322 STIM 5 MRK V false
323 STIM 6 MRK V false
324 STIM 7 MRK V false
325 STIM 8 MRK V false
326 STIM 101 MRK V false
327 SYST 201 OTHER none false Plot signal:
iview(meg)
Plot PSD of gradiometers:
plot_psd(meg,
ch="grad",
type=:mean)Plot PSD of magnetometers:
plot_psd(meg,
ch="mag",
type=:topo)Generate and apply embedded SSP projections:
apply_ssp_projectors(meg, proj=[1, 2, 3])