NeuroAnalyzer tutorials: MEG
Currently, MEG functionality is very limited.
Load MEG data:
using NeuroAnalyzer
meg = import_fiff("files/meg.fif");
[ Warning: data_skip is not implemented yet; if you have such a file, please send it to adam.wysokinski@neuroanalyzer.org
[33m[ Warning: Locations: ["IAS 307", "IAS 306", "IAS 309", "IAS 308", "IAS 311", "IAS 310", "IAS 302", "IAS 304", "IAS 301", "IAS 303", "IAS 305", "STIM 1", "STIM 2", "STIM 3", "STIM 4", "STIM 5", "STIM 6", "STIM 7", "STIM 8", "STIM 101", "SYST 201"] could not be found in the LOCS object.
[ Info: Imported: MEG (327 × 32000 × 1; 32.0 s)
Show signal details:
Data type: MEG
File format: FIFF
Source file: files/meg.fif
File size [MB]: 40.0
Memory size [MB]: 80.38
Subject: 2: Subject Subject
Recording: TRIUX system
Recording notes:
Recording date:
Recording time:
Sampling rate (Hz): 1000
Signal length [samples]: 32000
Signal length [seconds]: 32.0
Number of channels: 327
Epochs ID:
Number of epochs: 1
Epoch length [samples]: 32000
Epoch length [seconds]: 32.0
Line frequency: 50.0 Hz
Markers: no
Channel locations: yes
Components: no
Number of MAG channels: 102
Number of GRAD channels: 204
Number of EEG channels: 0
Channels:
ch label type unit bad
------ --------------- ----------- ------- -------
1 IAS 307 OTHER V false
2 IAS 306 OTHER V false
3 IAS 309 OTHER V false
4 IAS 308 OTHER V false
5 IAS 311 OTHER V false
6 IAS 310 OTHER V false
7 IAS 302 OTHER V false
8 IAS 304 OTHER V false
9 IAS 301 OTHER V false
10 IAS 303 OTHER V false
11 IAS 305 OTHER V false
12 MEG 111 MAG fT false
13 MEG 112 GRAD fT/cm false
14 MEG 113 GRAD fT/cm false
15 MEG 121 MAG fT false
16 MEG 122 GRAD fT/cm false
17 MEG 123 GRAD fT/cm false
18 MEG 131 MAG fT false
19 MEG 132 GRAD fT/cm false
20 MEG 133 GRAD fT/cm false
21 MEG 141 MAG fT false
22 MEG 142 GRAD fT/cm false
23 MEG 143 GRAD fT/cm false
24 MEG 211 MAG fT false
25 MEG 212 GRAD fT/cm false
26 MEG 213 GRAD fT/cm false
27 MEG 221 MAG fT false
28 MEG 222 GRAD fT/cm false
29 MEG 223 GRAD fT/cm false
30 MEG 231 MAG fT false
31 MEG 232 GRAD fT/cm false
32 MEG 233 GRAD fT/cm false
33 MEG 241 MAG fT false
34 MEG 242 GRAD fT/cm false
35 MEG 243 GRAD fT/cm false
36 MEG 311 MAG fT false
37 MEG 312 GRAD fT/cm false
38 MEG 313 GRAD fT/cm false
39 MEG 321 MAG fT false
40 MEG 322 GRAD fT/cm false
41 MEG 323 GRAD fT/cm false
42 MEG 331 MAG fT false
43 MEG 332 GRAD fT/cm false
44 MEG 333 GRAD fT/cm false
45 MEG 341 MAG fT false
46 MEG 342 GRAD fT/cm false
47 MEG 343 GRAD fT/cm false
48 MEG 411 MAG fT false
49 MEG 412 GRAD fT/cm false
50 MEG 413 GRAD fT/cm false
51 MEG 421 MAG fT false
52 MEG 422 GRAD fT/cm false
53 MEG 423 GRAD fT/cm false
54 MEG 431 MAG fT false
55 MEG 432 GRAD fT/cm false
56 MEG 433 GRAD fT/cm false
57 MEG 441 MAG fT false
58 MEG 442 GRAD fT/cm false
59 MEG 443 GRAD fT/cm false
60 MEG 511 MAG fT false
61 MEG 512 GRAD fT/cm false
62 MEG 513 GRAD fT/cm false
63 MEG 521 MAG fT false
64 MEG 522 GRAD fT/cm false
65 MEG 523 GRAD fT/cm false
66 MEG 531 MAG fT false
67 MEG 532 GRAD fT/cm false
68 MEG 533 GRAD fT/cm false
69 MEG 541 MAG fT false
70 MEG 542 GRAD fT/cm false
71 MEG 543 GRAD fT/cm false
72 MEG 611 MAG fT false
73 MEG 612 GRAD fT/cm false
74 MEG 613 GRAD fT/cm false
75 MEG 621 MAG fT false
76 MEG 622 GRAD fT/cm false
77 MEG 623 GRAD fT/cm false
78 MEG 631 MAG fT false
79 MEG 632 GRAD fT/cm false
80 MEG 633 GRAD fT/cm false
81 MEG 641 MAG fT false
82 MEG 642 GRAD fT/cm false
83 MEG 643 GRAD fT/cm false
84 MEG 711 MAG fT false
85 MEG 712 GRAD fT/cm false
86 MEG 713 GRAD fT/cm false
87 MEG 721 MAG fT false
88 MEG 722 GRAD fT/cm false
89 MEG 723 GRAD fT/cm false
90 MEG 731 MAG fT false
91 MEG 732 GRAD fT/cm false
92 MEG 733 GRAD fT/cm false
93 MEG 741 MAG fT false
94 MEG 742 GRAD fT/cm false
95 MEG 743 GRAD fT/cm false
96 MEG 811 MAG fT false
97 MEG 812 GRAD fT/cm false
98 MEG 813 GRAD fT/cm false
99 MEG 821 MAG fT false
100 MEG 822 GRAD fT/cm false
101 MEG 823 GRAD fT/cm false
102 MEG 911 MAG fT false
103 MEG 912 GRAD fT/cm false
104 MEG 913 GRAD fT/cm false
105 MEG 921 MAG fT false
106 MEG 922 GRAD fT/cm false
107 MEG 923 GRAD fT/cm false
108 MEG 931 MAG fT false
109 MEG 932 GRAD fT/cm false
110 MEG 933 GRAD fT/cm false
111 MEG 941 MAG fT false
112 MEG 942 GRAD fT/cm false
113 MEG 943 GRAD fT/cm false
114 MEG 1011 MAG fT false
115 MEG 1012 GRAD fT/cm false
116 MEG 1013 GRAD fT/cm false
117 MEG 1021 MAG fT false
118 MEG 1022 GRAD fT/cm false
119 MEG 1023 GRAD fT/cm false
120 MEG 1031 MAG fT false
121 MEG 1032 GRAD fT/cm false
122 MEG 1033 GRAD fT/cm false
123 MEG 1041 MAG fT false
124 MEG 1042 GRAD fT/cm false
125 MEG 1043 GRAD fT/cm false
126 MEG 1111 MAG fT false
127 MEG 1112 GRAD fT/cm false
128 MEG 1113 GRAD fT/cm false
129 MEG 1121 MAG fT false
130 MEG 1122 GRAD fT/cm false
131 MEG 1123 GRAD fT/cm false
132 MEG 1131 MAG fT false
133 MEG 1132 GRAD fT/cm false
134 MEG 1133 GRAD fT/cm false
135 MEG 1141 MAG fT false
136 MEG 1142 GRAD fT/cm false
137 MEG 1143 GRAD fT/cm false
138 MEG 1211 MAG fT false
139 MEG 1212 GRAD fT/cm false
140 MEG 1213 GRAD fT/cm false
141 MEG 1221 MAG fT false
142 MEG 1222 GRAD fT/cm false
143 MEG 1223 GRAD fT/cm false
144 MEG 1231 MAG fT false
145 MEG 1232 GRAD fT/cm false
146 MEG 1233 GRAD fT/cm false
147 MEG 1241 MAG fT false
148 MEG 1242 GRAD fT/cm false
149 MEG 1243 GRAD fT/cm false
150 MEG 1311 MAG fT false
151 MEG 1312 GRAD fT/cm false
152 MEG 1313 GRAD fT/cm false
153 MEG 1321 MAG fT false
154 MEG 1322 GRAD fT/cm false
155 MEG 1323 GRAD fT/cm false
156 MEG 1331 MAG fT false
157 MEG 1332 GRAD fT/cm false
158 MEG 1333 GRAD fT/cm false
159 MEG 1341 MAG fT false
160 MEG 1342 GRAD fT/cm false
161 MEG 1343 GRAD fT/cm false
162 MEG 1411 MAG fT false
163 MEG 1412 GRAD fT/cm false
164 MEG 1413 GRAD fT/cm false
165 MEG 1421 MAG fT false
166 MEG 1422 GRAD fT/cm false
167 MEG 1423 GRAD fT/cm false
168 MEG 1431 MAG fT false
169 MEG 1432 GRAD fT/cm false
170 MEG 1433 GRAD fT/cm false
171 MEG 1441 MAG fT false
172 MEG 1442 GRAD fT/cm false
173 MEG 1443 GRAD fT/cm false
174 MEG 1511 MAG fT false
175 MEG 1512 GRAD fT/cm false
176 MEG 1513 GRAD fT/cm false
177 MEG 1521 MAG fT false
178 MEG 1522 GRAD fT/cm false
179 MEG 1523 GRAD fT/cm false
180 MEG 1531 MAG fT false
181 MEG 1532 GRAD fT/cm false
182 MEG 1533 GRAD fT/cm false
183 MEG 1541 MAG fT false
184 MEG 1542 GRAD fT/cm false
185 MEG 1543 GRAD fT/cm false
186 MEG 1611 MAG fT false
187 MEG 1612 GRAD fT/cm false
188 MEG 1613 GRAD fT/cm false
189 MEG 1621 MAG fT false
190 MEG 1622 GRAD fT/cm false
191 MEG 1623 GRAD fT/cm false
192 MEG 1631 MAG fT false
193 MEG 1632 GRAD fT/cm false
194 MEG 1633 GRAD fT/cm false
195 MEG 1641 MAG fT false
196 MEG 1642 GRAD fT/cm false
197 MEG 1643 GRAD fT/cm false
198 MEG 1711 MAG fT false
199 MEG 1712 GRAD fT/cm false
200 MEG 1713 GRAD fT/cm false
201 MEG 1721 MAG fT false
202 MEG 1722 GRAD fT/cm false
203 MEG 1723 GRAD fT/cm false
204 MEG 1731 MAG fT false
205 MEG 1732 GRAD fT/cm false
206 MEG 1733 GRAD fT/cm false
207 MEG 1741 MAG fT false
208 MEG 1742 GRAD fT/cm false
209 MEG 1743 GRAD fT/cm false
210 MEG 1811 MAG fT false
211 MEG 1812 GRAD fT/cm false
212 MEG 1813 GRAD fT/cm false
213 MEG 1821 MAG fT false
214 MEG 1822 GRAD fT/cm false
215 MEG 1823 GRAD fT/cm false
216 MEG 1831 MAG fT false
217 MEG 1832 GRAD fT/cm false
218 MEG 1833 GRAD fT/cm false
219 MEG 1841 MAG fT false
220 MEG 1842 GRAD fT/cm false
221 MEG 1843 GRAD fT/cm false
222 MEG 1911 MAG fT false
223 MEG 1912 GRAD fT/cm false
224 MEG 1913 GRAD fT/cm false
225 MEG 1921 MAG fT false
226 MEG 1922 GRAD fT/cm false
227 MEG 1923 GRAD fT/cm false
228 MEG 1931 MAG fT false
229 MEG 1932 GRAD fT/cm false
230 MEG 1933 GRAD fT/cm false
231 MEG 1941 MAG fT false
232 MEG 1942 GRAD fT/cm false
233 MEG 1943 GRAD fT/cm false
234 MEG 2011 MAG fT false
235 MEG 2012 GRAD fT/cm false
236 MEG 2013 GRAD fT/cm false
237 MEG 2021 MAG fT false
238 MEG 2022 GRAD fT/cm false
239 MEG 2023 GRAD fT/cm false
240 MEG 2031 MAG fT false
241 MEG 2032 GRAD fT/cm false
242 MEG 2033 GRAD fT/cm false
243 MEG 2041 MAG fT false
244 MEG 2042 GRAD fT/cm false
245 MEG 2043 GRAD fT/cm false
246 MEG 2111 MAG fT false
247 MEG 2112 GRAD fT/cm false
248 MEG 2113 GRAD fT/cm false
249 MEG 2121 MAG fT false
250 MEG 2122 GRAD fT/cm false
251 MEG 2123 GRAD fT/cm false
252 MEG 2131 MAG fT false
253 MEG 2132 GRAD fT/cm false
254 MEG 2133 GRAD fT/cm false
255 MEG 2141 MAG fT false
256 MEG 2142 GRAD fT/cm false
257 MEG 2143 GRAD fT/cm false
258 MEG 2211 MAG fT false
259 MEG 2212 GRAD fT/cm false
260 MEG 2213 GRAD fT/cm false
261 MEG 2221 MAG fT false
262 MEG 2222 GRAD fT/cm false
263 MEG 2223 GRAD fT/cm false
264 MEG 2231 MAG fT false
265 MEG 2232 GRAD fT/cm false
266 MEG 2233 GRAD fT/cm false
267 MEG 2241 MAG fT false
268 MEG 2242 GRAD fT/cm false
269 MEG 2243 GRAD fT/cm false
270 MEG 2311 MAG fT false
271 MEG 2312 GRAD fT/cm false
272 MEG 2313 GRAD fT/cm false
273 MEG 2321 MAG fT false
274 MEG 2322 GRAD fT/cm false
275 MEG 2323 GRAD fT/cm false
276 MEG 2331 MAG fT false
277 MEG 2332 GRAD fT/cm false
278 MEG 2333 GRAD fT/cm false
279 MEG 2341 MAG fT false
280 MEG 2342 GRAD fT/cm false
281 MEG 2343 GRAD fT/cm false
282 MEG 2411 MAG fT false
283 MEG 2412 GRAD fT/cm false
284 MEG 2413 GRAD fT/cm false
285 MEG 2421 MAG fT false
286 MEG 2422 GRAD fT/cm false
287 MEG 2423 GRAD fT/cm false
288 MEG 2431 MAG fT false
289 MEG 2432 GRAD fT/cm false
290 MEG 2433 GRAD fT/cm false
291 MEG 2441 MAG fT false
292 MEG 2442 GRAD fT/cm false
293 MEG 2443 GRAD fT/cm false
294 MEG 2511 MAG fT false
295 MEG 2512 GRAD fT/cm false
296 MEG 2513 GRAD fT/cm false
297 MEG 2521 MAG fT false
298 MEG 2522 GRAD fT/cm false
299 MEG 2523 GRAD fT/cm false
300 MEG 2531 MAG fT false
301 MEG 2532 GRAD fT/cm false
302 MEG 2533 GRAD fT/cm false
303 MEG 2541 MAG fT false
304 MEG 2542 GRAD fT/cm false
305 MEG 2543 GRAD fT/cm false
306 MEG 2611 MAG fT false
307 MEG 2612 GRAD fT/cm false
308 MEG 2613 GRAD fT/cm false
309 MEG 2621 MAG fT false
310 MEG 2622 GRAD fT/cm false
311 MEG 2623 GRAD fT/cm false
312 MEG 2631 MAG fT false
313 MEG 2632 GRAD fT/cm false
314 MEG 2633 GRAD fT/cm false
315 MEG 2641 MAG fT false
316 MEG 2642 GRAD fT/cm false
317 MEG 2643 GRAD fT/cm false
318 STIM 1 MRK V false
319 STIM 2 MRK V false
320 STIM 3 MRK V false
321 STIM 4 MRK V false
322 STIM 5 MRK V false
323 STIM 6 MRK V false
324 STIM 7 MRK V false
325 STIM 8 MRK V false
326 STIM 101 MRK V false
327 SYST 201 OTHER none false
Plot signal:
Plot PSD of gradiometers:
plot_psd(meg, ch="grad", type=:mean)
Plot PSD of magnetometers:
plot_psd(meg, ch="mag", type=:topo)
Generate and apply embedded SSP projections:
apply_ssp_projectors(meg, proj=[1, 2, 3])